1.   Thu mẫu gót chân

Thuận lợi:
              + Cần một lượng máu nhỏ.
              + Không lẫn nguyên liệu từ máu người mẹ, vì vậy xét nghiệm có thể mở rộng với các loại bệnh khác
              + Kích thước giọt máu có thể được điều chỉnh dựa vào loại lancet phù hợp.
              + Mẫu máu có thể thu tại bất kỳ thời điểm nào sau khi sinh.
              + Thông tin của trẻ được đính kèm thẻ thu mẫu máu.
              + Vận chuyển mẫu đơn giản, dễ dàng đặc biệt có thể từ nhà.
              +  Kỹ thuật lấy máu đơn giản.
              + Quá trình thực hiện tương đối nhanh vì vậy ngăn chặn máu bị vón cục.
              + Có thể thu mẫu tại nhà.
              + Không cần tách riêng huyết thanh và tế bào máu.
              + Mẫu máu có thể được bảo quản trong thời gian dài.
Khó khăn:  
             + Nhân viên thu mẫu cần phải được đào tạo.                                                                                                       
             + Thẻ thu mẫu dễ bị nhiễm từ các nguồn bên ngoài như bụi, dầu hoặc cồn.
             + Cha mẹ trẻ lo lắng khi nhìn thấy con bị trích máu.
             + Nguy cơ bị tổn thương nếu quá trình thực hiện không đúng.
             + Lấy mẫu xét nghiệm cần được thực hiện sau 24 giờ sinh.
             + Kết quả xét nghiệm sẽ có giá trị khác với mẫu thu từ tĩnh mạch.
             + Nhiễm chéo có thể xuất hiện giữa cấc mẫu nếu đặt các mẫu tiếp xúc nhau.
             + Mẫu máu thu xong cần được làm khô trong  3-4 giờ tránh ánh nắng mặt trời trực tiếp.                                 

2.   Thu máu tĩnh mạch

Thuận lợi:
            + Phổ biến.
            + Sau khi lấy xong mẫu có thể được chuyển lên thẻ thu mẫu máu để lưu thông tin trẻ đi kèm.
Khó khăn:
            + Người thu mẫu cần có chuyên môn như bác sỹ hoặc y tá.
            + Cha mẹ của trẻ lo lắng khi nhìn thu mẫu trẻ.
            + Nguy cơ bị tụ mãu nếu quá trình lấy máu không được thực hiện đúng.
            + Kết quả xét nghiệm khác so với xét nghiệm sử dụng mẫu máu gót chân.
            + Vận chuyển và bảo quản máu ở dạng lỏng gặp nhiều khó khăn.
            + Cần yêu cầu tách riêng tế bào máu và huyết thanh hoặc huyết tương.
            + Yêu cầu máy móc hiện đại để phân tích nếu mẫu máu được chuyển lên thẻ thu mẫu.
            + Thông tin trẻ không đi kèm với mẫu nên dễ gây nhầm lẫn hoặc bị mất thông tin.

3.   Thu máu ngón tay

Thuận lợi:
           + Thu máu ngón tay thường nhanh và ít đau đớn hơn thu máu tĩnh mạch và cần ít máu hơn.
           + Kích thước giọt máu có thể được điều chỉnh dựa vào loại lancet phù hợp.
           + Thông tin của trẻ được đính kèm thẻ thu mẫu máu.
           + Vận chuyển mẫu đơn giản, dễ dàng đặc biệt có thể từ nhà.
           + Kỹ thuật lấy máu đơn giản.
           + Có thể thu mẫu tại nhà.
           + Không cần tách riêng huyết thanh và tế bào máu.
           + Mẫu máu có thể được bảo quản trong thời gian dài.
           + Được thực hiện ở cả trẻ em và người lớn tuổi khi mà không thể thu mẫu gót chân được nữa (0 – 6 tháng: thu máu gót chân, 6 tháng  – 2 năm thu mẫu ngón tay, bàn tay, tĩnh mạch).
Khó khăn:
           +Thu mẫu ngón tay dễ gây tổn thương hơn vì trẻ sơ sinh
           + Nên chọn thu mẫu ở ngón tay giữa hoặc ngón thứ 4, không thu mẫu ở ngón thứ 5
           + nhân viên thu mẫu cần phải được đào tạo.
           + Mẫu máu thu xong cần được làm khô trong  3 – 4 giờ tránh ánh nắng mặt trời trực tiếp.
           + Thẻ thu mẫu dễ bị nhiễm từ các nguồn bên ngoài như bụi, dầu hoặc cồn.
           + Cha mẹ trẻ lo lắng khi nhìn thấy con bị trích máu.
           + Nguy cơ bị tổn thương nếu quá trình thực hiện không đúng.
           + Nhiễm chéo có thể xuất hiện giữa cấc mẫu nếu đặt các mẫu tiếp xúc nhau.
           + Yêu cầu máy móc hiện đại để phân tích.